 基本上，每一種藻類有其特定生長地帶，其主要和所含色素的種類與含量比例有關，不同的色素所需的光波長亦不同，隨著光線強度及光質之變化，藻類的分佈亦受影響。一般在較陰暗地區或深海中，藻紅素（Phycoerythrin）與藻藍素（Phycocyanin）比葉綠素更能有效地吸收藍、綠光，故只含葉綠素及胡蘿蔔素之綠藻，其棲息地都靠近陸地及水較淺之處。此現象在海邊的垂直分佈上最為明顯，在潮間帶上部多為綠藻類，潮間帶中部以褐藻類居多，而低潮線附近及深海部份則多為紅藻類。除了地形、生長基質及光線之外，在海洋中，水溫的變化、潮汐、海浪波動、風、洋流、營養鹽、污染物、動物的掘食及活動、藻類間的相互競爭等，都是影響海藻生長與分佈的因子。由於不同的生物種類具有不同的適應能力，以及對不同環境的喜好程度也不盡相同，所以在不同環境裡，都會有不同的生物種類。
臺灣東北角各地進行海藻組成與分佈之調查研究中，發現有43屬52 種海藻出現在所有的調查地點，包括有：石蓴類
(Ulva spp.)、螺旋硬毛藻
(Chaetomorpha spiralis)、
擬剛毛藻
(Cladophoropsis herpestica)、指枝藻
(Valoniopsis pachynema)、阿拉伯松藻
(Codium arabicum)、棲狀褐茸藻
(Hincksia mitchellae)、厚緣藻
(Dilophus okamurae)、匍扇藻
(Lobophora variegata)、樹狀團扇藻(Padina
arborescens)、圈扇藻
(Zonaria diesingiana)、鐵釘菜(Ishige
okamurae)、囊藻(Colpomenia
sinuosa)、小海帶(Petalonia
binghamiae)、馬尾藻類(Sargassum
sp.)、紫菜類
(Porphyra spp.)、白果胞藻
(Tricleocarpa fragilis)、石花菜類
(Gelidium spp.)、翼枝菜
(Pterocladiella capillacea)、蜈蚣藻類(Grateloupia
spp.)、牛角樹
(Polyopes polyideoides)、繁枝鋸齒藻(Prionitis
ramosissima)、充滿耳殼藻(Peyssonnelia
distenta)、叉節藻類(Amphiroa
spp.)、小珊瑚藻
(Corallina pilulifera)、叉珊藻
(Jania adhaerens)、異邊孢藻
(Marginisporum aberrans)、寬珊藻
(Mastophora rosea)、小杉藻
(Chondracanthus intermedius)、角叉菜(Chondrus
spp.)、日本沙菜
(Hypnea japonica)、扇形叉枝藻
(Ahnfeltiopsis flabelliformis)、
海木耳 (Sarcodia montagneana)、鋸齒麒麟藻
(Eucheuma serra)、 雞冠菜
(Meristotheca papulosa)、縱胞藻
(Centroceras clavulatum)、凹頂藻類(Laurencia
spp.)等。這 52種海藻均可作為東北角海藻群聚結構的主要代表。
另方面，蘚狀束藻 (Symploca hydnoides)、海雹菜 (Brachytrichia quoyi)、粗矮小網藻 (Microdictyon okamurae)、臺灣綠毛藻 (Chlorodesmis caespitosa)、齒形蕨藻 (Caulerpa serrulata f. lata)、毛孢藻 (Chnoospora implexa)、軟粉枝藻(Liagora ceranoides)、東方粉枝藻 (Liagora orientalis)及大齒心藻(Serraticardia maxima)等藻類，只出現在少數地點，其數量稀少、分佈又狹隘，是屬於此地的稀見種類。
基本上，龍洞、澳底、香蘭、馬崗、鸚歌石、石城及大溪等地點，因具有裙礁海岸、海蝕平臺、或具有大小不一的潮池與溝渠，適合各種類型海藻生長，故藻類相最豐富。而南雅的海岸較陡峭及北關的巨礫海岸，藻類種類就較少些。和美的礫石海岸，藻類只見於一般大岩石上，石粒徑愈大或表面越粗糙，越能提供較穩固的基底供藻類附著生長，或使海藻的孢子及幼苗可找到一些保護的微小窪地或裂縫，以免乾死或被其他生物掘食。在福隆一帶則多為沙灘，基質易被海浪沖刷流失，較不適合海藻生長，故藻類相最貧瘠。
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