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採集方法，可分潮間帶採集及潛水採集，潛水又分浮潛和水肺潛水。採集時，可徒手或利用工具進行採集。
採集標本時，必須注意標本的完整性，並選擇具有生殖器官的藻體，如紅藻類的四分孢子囊、囊果、精子囊和馬尾藻的生殖托等，是藻類分類的重要根據。這些生殖器官有些可用肉眼觀察到，即藻體的一部分變色、或藻體表面、或特別小枝上具有瘤狀突起或斑點等。此外，了解海藻的生活習性，對種的鑑定有相當之幫助，故各種海藻的形態、顏色、產量、生長基質、生長潮帶及其周圍環境，都應詳盡的觀察與記錄。
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不同性質的藻體應作不同處理，如個體大且不易腐爛的藻體，如石蓴、鐵釘菜及馬尾藻等，可直接放採集桶或採集袋中，對細小或柔軟富黏液藻體、或質地易脆藻體，則分別裝入採集瓶中固定，或用小塑膠袋盛裝，並用油性簽字筆在塑膠袋上註明編號。
海藻標本的搬運：在海邊採到的新鮮藻體，置於塑膠袋或塑膠瓶中後，最好能放在陰涼的地方。於攜帶途中，儘量要避免陽光的直接照射或曝露在高溫下，以免藻體褪色。 |
